引用7000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更好地处理FASTQ数据

2023年5月8日，海普洛斯生物科技有限公司陈实富在 iMeta 在线发表了题为“Ultrafast one-pass FASTQ data preprocessing,quality control,and deduplication using fastp”的文章。本研究表明fastp已经得到了许多生物信息学...

iMeta｜引用7000＋，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更快更好地处理FASTQ数据

使用fastp进行超快的FASTQ数据预处理、质量控制和去重 Fastp 是一种广泛采用的 FASTQ 数据预处理和质量控制工具。它超快且用途广泛，可以在单次数据扫描中执行接头移除、全局或质量修整、读长过滤、去冗余、碱基校正和许多其他...

技术干货：SRA 数据上传指南_Portal_格式_信息

（1）测序原始结果文件，例如 fasta、fastq 等格式的文件。（2）测序结果与参考基因组比对结果文件，例如 bam 格式。如需上传压缩文件，请使用 Linux 命令行 gzip/bzip2/tar 命令进行压缩（例如云序常见提供的 gz 格式的测序...

PHLAT：从转录组数据或者全外显子组测序数据预测HLA 类型_fastq

PHLAT 利用RNAseq 或全外显子组测序生成的 FASTQ 格式的输入数据，参考基因组由整个人类基因组(hg19)和来自 IMGT 的 HLA 等位基因的集合组成。它还需要安装 Bowtie2 和一系列指定的 Python 模块。PHLAT 的输出是主要 MHC I 类...

高通量测序：什么是FASTQ格式？

FASTQ格式是一种文本形式的格式，主要用于保存核酸序列和测序质量。序列和质量都用ASCII编码来表示，是目前的高通量测序结果的标准。FASTQ格式一般有四行： 序列编号和描述信息，用@开头 序列，包括ATGC和N 以加号开头，是序列...

生信人必会！你知道如何下载ENA 数据库的数据吗？https

可以看到，是刚才在ENA 下载的TSV文件数据的fastq_ftq列的信息,具体格式为： 它就是@后指定的下载地址，单个指点下载地址为 命令中的 udata/zhenggm/bioTree/trans_upAnal/PRJEB25780_trans/ 为指定的数据下载的存放路径 6....

易基因｜干货：cfDNA甲基化测序实验怎么做，看完你就知道了

测序⽚段被⾼通量测序仪测得的图像数据经CASAVA碱基识别转化为序列数据（reads），⽂件为fastq 格式，其中主要包含测序⽚段的序列信息以及其对应的测序质量信息。fastq格式⽂件中每个read由四⾏描述信息组成，如下所示： 图：...

干货：cfDNA甲基化测序实验怎么做，看完你就知道了

图：FASTQ格式示例 上述⽂件中第⼀⾏以“@”开头，随后为Illumina测序标识符(Squence Identifiers)和描述⽂字；第⼆⾏是测序⽚段的碱基序列；第三⾏以“+”开头，随后为Illumina测序标识符(也可为空)；第四⾏是测序⽚段每个...

精准简化基因组甲基化测序(RRBS)分析怎么做？技术_oxRRBS_检测

测序⽚段被⾼通量测序仪测得的图像数据经CASAVA碱基识别转化为序列数据（reads），⽂件为fastq 格式，其中主要包含测序⽚段的序列信息以及其对应的测序质量信息。fastq格式⽂件中每个read由四⾏描述信息组成，如下所示： 图：...

高分Science子刊关注：粪菌移植如何减少耐药菌定植|热心肠日报

② aMeta流程接受标准fastq格式数据，包含使用Cutadapt删除测序接头、运行KrakenUniq预筛选、对aDNA序列进行分类等步骤；③ aMeta结合了基于k-mer分类法在灵敏度及最低共同祖先法在微生物发现和认证特异性方面的优点；④ 使用...

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• 凯立德导航无线网怎么用
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• 三星手机i9300开不了机怎么办
• 怎么看自己的卡是移动还是电信
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• 电子绕磁场怎么走
• 华硕笔记本怎么调屏幕
• 三星平板连接优盘怎么看
• 怎么通过手机注册绑定qq号码
• 没有QQ号码怎么用微信电话本
• 三星怎么导电话出来找不到导出
• note5怎么设置卡2铃声
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